Nakon raspada Jugoslavije, istorijska regija Makedonija koja joj je pripadala postala je nezavisna država, tačnije njen glavni dio (98% ove teritorije poklapa se sa zemljama istorijske Vardarske Makedonije, oko 2% je dio Srbije).
Makedonija je 17. septembra 1991. proglašena nezavisnom državom, a već u januaru 1992. lokalni Albanci održali su referendum o autonomiji osam regija ove zemlje. U to vrijeme (prema popisu iz 1991.), etnički sastav ove republike bio je sljedeći: Makedonci (65,1%), Albanci (21,7%), Turci (3,8%), Rumuni (2,6%), Srbi (2, 1 %), Muslimani-Bošnjaci (1,5%). Prema popisu iz 1994. godine, broj Albanaca se povećao na 22,9% (442.914 ljudi). Živjeli su uglavnom u sjeverozapadnim, sjevernim i nekim centralnim regijama zemlje i činili su većinu stanovništva zajednica Tetova, Gostivara, Debra, Strugija i Kičeva.
Godine 1992. makedonska vlada, uznemirena situacijom na Kosovu, zatražila je od UN -a da pošalje mirovne snage. Ovaj zahtjev je odobren, ali se 1998. situacija u zemlji naglo pogoršala: organizirano je 1884 teroristička napada u kojima je poginulo oko 300 ljudi. Jedinice unutrašnjih snaga Ministarstva unutrašnjih poslova Jugoslavije pronašle su 24. maja ove godine masovnu grobnicu Srba i Albanaca njima lojalnih koje su ubili separatisti u blizini grada Preševa. 1999. godine mirovne snage UN -a ustupile su mjesto NATO trupama. Ionako tešku situaciju pogoršao je dolazak muslimanskih izbjeglica sa Kosova u Makedoniju. Do 17. maja 1999. godine u Makedoniji je bilo 229.300 kosovskih Albanaca (više od 11% ukupnog stanovništva zemlje), u drugoj polovini ove godine njihov se broj povećao na 360.000.
1998-1999 neki makedonski Albanci borili su se na Kosovu, sticajući borbena iskustva i uspostavljajući veze sa komandantima vojske ove nepriznate države. Po uzoru na Oslobodilačku vojsku Kosova, Makedonija je stvorila svoje oružane formacije (Narodnooslobodilačka vojska - PLA). Njihov komandant bio je Ali Ahmeti, koji je kasnije bio na čelu Stranke demokratske unije za integraciju.
Makedonija u 21. veku
Krajem 2000. godine albanski militanti počeli su napadati makedonske policajce i vojnike. Pobunjenici su, s jedne strane, htjeli proporcionalno učešće u svim državnim strukturama, ali s druge strane, zalagali su se za albansku autonomiju na području grada Tetova, pa čak i za ujedinjenje svih balkanskih teritorija nastanjenih Albancima u jedinstvenu Velika Albanija. Oslobodilačka vojska Kosova takođe je pružila pomoć makedonskim Albancima.
22. januara 2001. napali su policijsku stanicu u selu Tirs u blizini grada Tetova. Konačno, u martu, nakon 5 dana napada na vladine kancelarije u okolini Tetova, makedonska vojska je izvela vojnu operaciju, raselivši jedinice PLA na Kosovu.
Albanski militanti u blizini sela Bliz Tetovo 28. aprila ispalili su bacače granata i minobacača na vojnike odreda Vukovi makedonskih snaga bezbjednosti koji patroliraju kosovsko-makedonskom granicom: 8 makedonskih vojnika je poginulo, a još 8 je povrijeđeno.
A početkom maja, takozvana "113. brigada PLA" ušla je u zemlju sa Kosova, zauzevši nekoliko sela severno od Kumanova."Oslobodioci" su zarobili oko hiljadu lokalnih stanovnika, koje su namjeravali koristiti kao živi štit. Kao rezultat tvrdoglavih borbi, makedonska vojska je uspjela poraziti Albance i uništiti komandanta "brigade" - kosovskog Albanca Fadila Nimanija.
6. juna 2001., usred borbi, terorist koji se automobilom bugarskih (sofijskih) registarskih oznaka dovezao do zgrade parlamenta u Skoplju, pucao je u kancelariju predsjednika Makedonije Borisa Traikovskog (u to vrijeme lidera tu je bio i Socijaldemokratski savez Makedonije Branko Crvenkovsky). Niko od njih nije povrijeđen.
Do raspleta je došlo 25. juna, kada je makedonska vojska, koja je okružila selo Arachinovo, koje su zauzeli Albanci, zaustavljena po naredbi predsjednika: pobunjenici su otišli u autobusima koji su im bili dostavljeni u pratnji predstavnika EU i NATO, sa sobom nose oružje, kao i ranjene i ubijene militante.
Iste večeri, gomila Makedonaca ogorčenih "izdajom" Troikovskog (koja broji nekoliko hiljada ljudi) upala je u zgradu parlamenta, gdje su u to vrijeme Traikovsky i drugi najviši lideri Makedonije pregovarali s liderima albanskih stranaka. Ovom napadu prisustvovali su neki policajci i vojnici koji su stigli iz Arachinova i zahtijevali da objasne zašto im je naređeno da puste osuđene militante iz sela. Predsjednik je morao biti evakuiran. Razlog za ovu neshvatljivu naredbu postao je poznat kasnije. Godine 2002. Glenn Nye, bivši službenik Stejt departmenta u američkoj ambasadi u Makedoniji, rekao je da je tokom događaja u junu 2001. spasio 26 američkih državljana zarobljenih u Arachinovu. Ubrzo je postalo jasno da se radi o zaposlenicima ugledne američke privatne vojne kompanije Military Professional Resources Incorporated. U avgustu 1995. godine, njeni "specijalci" učestvovali su u operaciji "Oluja", tokom koje je hrvatska vojska zauzela teritoriju Srpske Krajine. A 2008. godine zaposlenici MPRI -a učestvovali su u obuci gruzijskog vojnog osoblja i reorganizaciji vojske ove zemlje prema standardima NATO -a.
Trenutno, nasljednik MPRI -a je PMC Engility.
O privatnim vojnim kompanijama (uključujući MPRI) govorilo se u članku "Privatne vojne kompanije: respektabilan posao ugledne gospode".
Dana 5. jula 2001. godine, makedonska vlada i albanski lideri potpisali su "Opšti sporazum" o prekidu vatre, koji su militanti PLA prekršili 139 puta do kraja avgusta.
Dana 10. avgusta, 600 makedonskih Albanaca iz PLA i neodređen broj boraca Kosovskog odbrambenog korpusa ušli su u Makedoniju iz kosovskog grada Krivineka. Daljnji događaji nazvani su "Bitka kod Raduše": uz pomoć avijacije ovaj napad je odbijen.
Konačno, 13. avgusta zaključen je Ohridski sporazum o prekidu vatre: makedonska vlada se složila da izmijeni ustav kako bi ukinula priznavanje Makedonaca za titularnu naciju i garantovala albanskom jeziku službeni status u područjima kompaktnog albanskog prebivališta. Ove sporazume je odobrio makedonski parlament 16. novembra 2001. Međutim, strane su uspjele postići konačan sporazum tek u januaru 2002.
Ovi sporazumi donijeli su zemlji samo "loš mir" umjesto "dobrog rata": međuetnički sukobi još uvijek nisu neuobičajeni, posebno u julu 2014. godine, kada su Albanci nekoliko dana uništavali glavni grad zemlje, Skoplje. Stoga su protestirali protiv osude saplemenika proglašenih krivim za strijeljanje grupe Makedonaca uoči Uskrsa 2012.
Vlasti moderne Grčke, gdje su već u XX stoljeću uloženi veliki napori u helenizaciji Južne Makedonije, nakon raspada Jugoslavije dugo su odbijale sjeverni dio ove historijske teritorije nazvati Makedonijom, insistirajući na imenu "Republika Centralnog Balkana" ". Susjedi su nekako uspjeli doći do kompromisa, pa se „Bivša jugoslavenska republika Makedonija“pojavila na mapi Evrope, pod tim imenom zemlja se pridružila UN -u 1993. A tek nedavno (od 12. februara 2019.) ova bivša republika dobila je ime "Sjeverna Makedonija".
Trenutno 67% stanovnika Sjeverne Makedonije ispovijeda pravoslavlje, 30% su muslimani (u vrijeme raspada socijalističke Jugoslavije, 21% stanovništva ove republike izjasnilo se da se pridržava islama).
Autonomna Pokrajina Kosovo i Metohija (Republika Kosovo)
Prije osmanskog osvajanja, kosovske zemlje bile su jezgro srpske države; tu se, od 14. vijeka do 1767. godine, u blizini grada Peći, nalazilo prijestolje srpskog patrijarha. Ovde, nedaleko od Prištine, postoji mesto koje ima zaista sveto značenje za srpski narod - kosovsko polje, šetajući po kome su 1912. godine tokom Drugog balkanskog rata neki srpski vojnici skinuli cipele, dok su drugi "pali na koljena i poljubili zemlju ":
Tito je 1945. godine dozvolio Albancima koji su se tamo nastanili tokom Drugog svetskog rata da ostanu na Kosovu. Oni su se ovdje pojavili pod sljedećim okolnostima: vojnici zloglasne dobrovoljačke albanske SS divizije "Skanderbeg" (o tome u drugom članku) protjerali su oko 10 hiljada slovenskih porodica sa Kosova, a 72 hiljade Albanaca iz sjevernih regija ove zemlje naseljeno je "oslobođene" zemlje … Budući da je Jugoslavija pretrpjela značajne ljudske gubitke tokom Drugog svjetskog rata, proglašavanje ovih doseljenika građanima zemlje činilo se razumnom odlukom. Međutim, dalji događaji pokazali su da je to bila strašna greška jugoslovenskih vlasti, a prvi neredi povezani sa djelovanjem Albanaca na Kosovu i Metohiji dogodili su se već 1981. godine.
Muslimanski Sloveni na Kosovu i Metohiji
Na jugu Kosova i u Metohiji živjele su kompaktne grupe muslimanskih Slovena: Goranci, Podgorijani, Sredti i Rafani, koji su živjeli na jugu Kosova i Metohije.
Najmanja grupa muslimana u Makedoniji su Podgori - ima ih samo oko 3 hiljade. To su potomci crnogorskih muslimana koji su se doselili nakon Drugog svjetskog rata da žive pored svojih vjernika. Ova grupa stanovništva ubrzano se albanizira i vjeruje se da će se uskoro konačno stopiti s Albancima. Njihovi susjedi, srednji stanovnici, koji se nazivaju i zhuplians, žive u regiji Sredskaya Zhupa. Teritorija Goranaca nalazi se na jugu Kosova. Za razliku od Arnautaša (to jest, albaniziranih potomaka dijela muslimanskih Srba na Kosovu) i njihovih susjeda, Opoljaca, oni su zadržali jezik koji nazivaju balkansko-slavenskim (bugarsko-makedonsko-srpskim), iako s brojnim posuđenicama turskog jezika, Albanske, pa čak i arapske riječi.
Međutim, albanski historičari smatraju Gorance Ilirima, Bugare - Bugare, Makedonce - Makedonce. Tokom popisa stanovništva, ti ljudi sami sebe nazivaju Gorancima, Bošnjacima, Srbima, a neki čak i Turcima i Albancima. Kulturno, Goranci su bliski makedonskim torbešima, bugarskim Pomacima i bosanskim Slovenima koji su prešli na islam - Bošnjacima (dok su Bosanci ljudi koji žive u Bosni i Hercegovini, bez obzira na nacionalnost).
U gradu Orahovcu i okolini žive Rafchane - potomci albaniziranih Slovena, od kojih se mnogi sada smatraju Albancima, ali govore prizrensko -južnomoravskim dijalektom srpskog jezika.
Kosovo u sastavu Jugoslovenske Republike Srbije
Kosovo i Vojvodina postali su "socijalistički autonomni regioni" unutar Srbije.
Kosovo je 1974. godine povećalo svoj status, dobivši prava republike - sve do svog ustava, pravo da formira najviše organe vlasti i delegacije predstavnika u zakonodavnim i upravnim tijelima Unije. Novi ustav Jugoslavije, koji je stupio na snagu 28. septembra 1990., proglasio je prioritet republičkih zakona u odnosu na regionalne, ostavljajući Kosovu teritorijalnu i kulturnu autonomiju. Kosovski Albanci su odgovorili najavom stvaranja nezavisne države, za koju je Ibrahim Rugova izabran za predsednika, a 1996. godine stvorena je i Oslobodilačka vojska Kosova.
Rat na Kosovu i operacija Savezničke snage
1998. godine ovdje je izbio rat koji je izazvao poplavu izbjeglica s obje strane.
24. marta 1999. godine, bez sankcija UN-a, započela je vojna operacija NATO-a pod kodnim nazivom Savezničke snage, tokom koje su bombardovani mnogi vojni i civilni ciljevi u Srbiji. Trajalo je 78 dana, bilo je uključeno preko 1000 aviona (5 aviona, 16 bespilotnih letelica i 2 helikoptera je izgubljeno). Ukupno je izvršeno 38 tisuća letova, napadnuto je ukupno oko tisuću i pol naselja, korišteno je 3 tisuće krstarećih projektila i 80 tisuća tona bombi, uključujući bombe sa kasetnim i osiromašenim uranijumom. Preduzeća vojno-industrijskog kompleksa i vojne infrastrukture, rafinerije nafte, skladišta nafte potpuno su uništena, 40 hiljada stambenih zgrada, 422 škole, 48 bolnica, 82 mosta (uključujući sve mostove preko Dunava), oko 100 različitih spomenika uništeno.
Ukupna materijalna šteta iznosila je oko 100 milijardi dolara. Više od dvije hiljade ljudi postalo je žrtvama bombardovanja, oko 7 hiljada je povrijeđeno.
Glavna kopnena grupa NATO snaga (12 hiljada ljudi pod komandom britanskog generala Michael David Jackson) bila je stacionirana u Makedoniji tokom ove operacije. Britanci su trebali preuzeti kontrolu nad aerodromom Slatina u Prištini, ali su mu se približili 4 sata kasnije od bataljona ruskih padobranaca (200 vojnika i oficira, 8 oklopnih transportera, komandant - S. Pavlov, izviđačka grupa je bila kojim je zapovijedao Yunus-bek Evkurov) čuveno "bacanje" iz Bosne (600 km).
Jackson je tada odbio izvršiti naredbu američkog generala Wesleyja Clarka (zapovjednika združenih snaga NATO -a) da blokira aerodrom i zada "pogrešne" napade, odgovarajući mu:
Neću započeti treći svjetski rat.
Vlasti Jugoslavije bile su prisiljene povući trupe s teritorije Kosova, čime su izgubile kontrolu nad njom.
Nakon završetka operacije NATO -a na Kosovu, ubijeno je još oko 1.000 ljudi. Oko 350 hiljada ljudi postalo je izbjeglica (200 hiljada njih su Srbi i Crnogorci), oko 100 crkava i manastira je uništeno ili oštećeno.
Dana 17. februara 2008. godine, kosovski parlament je proglasio nezavisnost, koju su priznale 104 zemlje sveta (uključujući Makedoniju). 60 država i dalje smatra Kosovo autonomnom pokrajinom u sastavu Srbije (uključujući Rusiju, Kinu, Indiju, Izrael).
