Glavni razlog hapšenja Nikolaja Vavilova bio je sukob s agronomom Trofimom Lysenkom, koji je počeo širiti svoje ideje na sve biološke znanosti.
Narodni komesar Beria napisao je 16. jula 1939. Molotovu:
„NKVD je razmotrio materijale koji su nakon imenovanja Lysenka TD-a predsjednika Akademije poljoprivrednih znanosti, Vavilov NI i buržoaske škole takozvane„ formalne genetike “na čijem je čelu organizirali sustavnu kampanju diskreditacije Lysenka kao znanstvenika … Stoga tražim vaš pristanak za hapšenje NI Vavilova.
Može se reći da je za sovjetski režim zatvaranje naučnika ove veličine bio prilično ozbiljan problem. Zato je vrijeme hapšenja dugo birano i pomno se računalo. Kao rezultat toga, izabrali su avgust 1940. - Drugi svjetski rat trajao je skoro godinu dana (Francuska je pala), a Evropljani više nisu bili u stanju da prate sudbinu sovjetskog biologa. Osim toga, u to je vrijeme Vavilov otišao na ekspediciju u zapadnu Ukrajinu u regiju Chernivtsi. Moramo odati priznanje specijalnim službama - sve su radile sasvim tiho, a dugo vremena naučna zajednica uopće nije znala gdje se nalazi Nikolaj Vavilov. Mnogi vjeruju da je sama ekspedicija na mnogo načina bila zamka za akademika. Kao rezultat toga, 6. avgusta 1940. naučnik je uhapšen. I svi u NKVD -u savršeno su razumjeli da će pogubljenje biti kazna.
Počeli su prikupljati prljavštinu i izmišljati krivični postupak protiv Vavilova mnogo prije 1940. godine. Već u ranim tridesetim, od uhapšenih agronoma i biologa diljem zemlje, pretukli su svjedočanstva u kojima je naučnik proglašen ideologom grupe odgovorne za organizaciju gladi u zemlji. Tako je šumar V. M. Savich iz Khabarovska pod mučenjem svjedočio protiv lokalnog povjesničara V. K. Arsenyeva, a Vavilov je optužen za prenošenje informacija Japancima. Naučnik je i sam saznao za neka od ovih "priznanja". Šef odjela krmnih kultura Sveruskog instituta za biljnu industriju P. P. Zvoryakin uhapšen je, a nakon iscrpljujućih ispitivanja i mučenja potpisao je sve što mu je ponuđeno. Optužbe su prirodno pale na njega i njegove kolege sa instituta. Vavilov je, saznavši za to, rekao:
"Ne krivim ga, osjećam veliko žaljenje zbog njega … pa ipak, svejedno, i prezir …"
Očigledno, od tog trenutka naučnik je shvatio da bi u svakom trenutku mogao biti poslan u zatvor po izmišljenoj optužbi-specijalne službe su već prikupile dovoljno dokaza koji otkrivaju njegove "antisovjetske" aktivnosti.
Staljin takođe nije sebi uskratio razdražljive komentare o Vavilovu. Tako je 1934. na jednom od sastanaka biolog pogriješio i predložio da Sovjetski Savez iskoristi najbolje američko iskustvo u poljoprivredi. Prema Vavilovu, to bi se moglo opravdati. Kao odgovor, Staljin je otvoreno suprotstavio istraživača drugim:
„Vi, profesore, mislite tako. Mi boljševici mislimo drugačije."
Do tada je Staljin obaviješten iz OGPU-a o otkrivanju "članova kontrarevolucionarne organizacije u poljoprivredi" koju su činili Nikolaj Vavilov, Nikolaj Tulajkov i Efim Liskun. S ovog popisa samo su ovi drugi mogli izbjeći hapšenje. U prethodnom dijelu materijala o Nikolaju Vavilovu detaljnije je opisan odnos između Staljina i znanstvenika.
Uprkos očiglednoj prijetnji, sve do hapšenja Vavilov se nastavio aktivno baviti naukom. Nekoliko njegovih fraza ušlo je u istoriju:
“Život je kratak, moramo požuriti”, “Radimo i radit ćemo” i “Nema vremena za čekanje dok ne dođe najbolje vrijeme”.
Do 1940. agronom, geograf i genetika Nikolaj Vavilov pokušavao je prikupiti što je moguće više biljnog materijala širom svijeta radi daljnje aklimatizacije u zemlji. Sovjetski Savez se odlikovao širokim spektrom klimatskih uvjeta koji su zahtijevali opsežan izvorni materijal za uzgojne radove. To je učinjeno samo djelomično.
Valja posebno napomenuti da je Vavilov imao priliku boraviti u inostranstvu i pronaći dostojno mjesto u naučnoj svjetskoj eliti. Tako je, na primjer, učinio genetičar Theodosius Dobrzhansky kada je 1931. boravio u Sjedinjenim Državama, što mu je, naravno, spasilo život i postalo svjetski poznati genetičar. Dobrzhansky je radio u grupi dopisnog člana Akademije nauka SSSR -a, citologa Grigorija Levitskog, koji je takođe bio pod pritiskom u vezi sa slučajem Vavilov i umro je u zatvorskoj bolnici 1942. godine. U isto vrijeme, mnogi učenici Levitskog bili su potisnuti. Ili uzmite primjer biologa Nikolaja Vladimiroviča Timofejeva-Resovskog, kojeg je akademik Nikolaj Koltsov 1937. godine odvratio od povratka iz Njemačke u Sovjetski Savez. U to je vrijeme Timofeev-Resovsky vodio odjel za genetiku i biofiziku na Institutu za istraživanje mozga u Buchu, Njemačka (predgrađe Berlina). Istovremeno, Nikolaj Vavilov predao je svom stranom kolegi notu u kojoj se upozorava na skoro hapšenje po dolasku kući. Sin Timofejeva-Ressovskog u Njemačkoj je bačen u logor zbog antifašističkih aktivnosti, gdje je i umro. Nakon rata za izdaju, biolog je osuđen na 10 godina logora. Nikolaj Koltsov je proganjan u vezi sa slučajem Vavilov i umro je od srčanog udara 1940.
1.700 sati ispitivanja
Akademikovi rođaci su od jeseni 1940. učinili sve što je bilo moguće u to vrijeme da budu oslobođeni. Vavilovljeva supruga Elena Barulina bila je na prijemu tužitelja SSSR -a Bochkova, ali uzalud. Porodica uhapšenog naučnika imala je neverovatnu sreću - pozvani su da žive u selo Ilyinskoye u blizini Moskve, gde je živela porodica drugog potisnutog genetičara, profesora Georgija Karpečenka. Vavilovi su napustili Lenjingrad u maju 1941. godine, nekoliko mjeseci prije početka blokade grada, u kojoj invalid prve grupe, Elena Barulina, ne bi preživio. A 28. jula 1941. strijeljan je i sam Karpečenko - bivši šef odjela za genetiku Sveruskog instituta biljne industrije i odgovarajućeg odjela Lenjingradskog univerziteta. On je bio prvi genomski inženjer na svijetu koji je uspio spojiti dvije biljke u jedan organizam - kupus i rotkvicu. Rezultat je hibrid rijedak kupus koji nema analoga u svijetu. Razlog hapšenja i pogubljenja bio je spor sa sljedbenicima Trofima Lysenka. Karpechenko je optužen za kriminalne aktivnosti pod vodstvom Nikolaja Vavilova.
Nakon hapšenja, Vavilov je ispitivan 400 puta, a ukupno trajanje iscrpljujućih ispitivanja dostiglo je 1.700 sati. Kao rezultat toga, istražitelji su "otkrili" da je akademik od 1925. bio jedan od vođa organizacije "Radnička seljačka stranka". Zatim se 1930. pridružio određenoj desničarskoj organizaciji koja je svoju subverzivnu djelatnost vodila u gotovo svim institucijama u kojima je bio Vavilov. Ciljevi naučnikovog rada bili su podrivanje i likvidacija sistema kolektivnih farmi kao fenomena, kao i kolaps poljoprivrede zemlje. No, pokazalo se da takve optužbe nisu bile dovoljne za smrtnu kaznu, a tužilac je dodao još veza sa bijelim emigrantskim krugovima u inostranstvu. To je bilo dovoljno lako učiniti, jer je Vavilov često odlazio na naučna putovanja u inostranstvo, što ga je automatski činilo nepouzdanim. Vrijedno je naglasiti poseban utjecaj Trofima Lysenka na tok istražnog postupka nad akademikom Vavilovom, na koji mnogi ljudi zaboravljaju. Zloglasni istražitelj Khvat, koji se tokom ispitivanja otvoreno rugao akademiku, 5. maja 1941. poslao je načelniku istražne jedinice NKGB -a Vlodzimirskom zahtjev za odobrenje sastava stručne komisije u slučaju Vavilov. Lista je odobrena tek nakon vize Trofima Lysenka …
Osuda na smrtnu kaznu objavljena je 9. jula 1941. godine, a mjesec i po dana kasnije molba za pomilovanje je odbijena. Tokom suđenja, Vavilov je djelomično priznao svoju krivicu, ali je kasnije u izjavi naveo da će povući svoj iskaz. 12. avgusta 1940. naučnik je o raspletu suđenja rekao:
“Vjerujem da su materijali s kojima raspolaže istraga jednostrani i pogrešno osvjetljavaju moje aktivnosti i očito su rezultat neslaganja u naučnom i službenom radu s brojnim osobama koje su, po mom mišljenju, tendenciozno okarakterizirale moje aktivnosti. Vjerujem da ovo nije ništa drugo do dizanje klevete protiv mene."
Zanimljivo je da je Georgij Karpečenko bio među mnogim ljudima koji su u odsutnosti svjedočili protiv Vavilova. Kasnije se ispostavilo da je većina svjedočenja jednostavno izmišljena. Dakle, u slučaju Vavilov postoji dokument od 7. avgusta 1940. godine, u kojem se navodi svjedočenje izvjesnog Muralova, koji je strijeljan kao "narodni neprijatelj" davne 1937. godine.
Uprkos naizgled odlučenoj sudbini akademika, u maju 1942. Merkulov je napisao pismo predsjedniku Vrhovnog suda SSSR -a Ulrihu sa zahtjevom za ukidanje smrtne kazne za Nikolaja Vavilova. On tu ideju objašnjava mogućnošću privlačenja naučnika na rad od odbrambenog značaja. Očigledno, nije se radilo o specifičnim biološkim ili agronomskim istraživanjima - htjeli su uključiti znanstvenika u rad logora. U ovom pismu Merkulov je takođe tražio ukidanje pogubljenja za akademika i filozofa Luppol Ivana Kapitonovića, koji je zajedno sa Vavilovom bio osuđen na smrt u zatvoru u Saratovu. Kao rezultat toga, Luppol je proveo 20 godina u logorima i umro 1943.
Vavilov nije zaboravljen u inostranstvu. 23. aprila 1942. izabran je za člana Londonskog kraljevskog društva, a četiri dana kasnije na smrtnu kaznu je prijavljeno da je pogubljenje zamijenjeno 20 -godišnjim logorima prisilnog rada. Je li ovaj korak bio nekako povezan s reakcijom Zapada? Bilo kako bilo, 26. januara 1943. akademik Nikolaj Vavilov umro je u zatvoru od distrofije ili, prema drugim izvorima, od srčanog udara. Nisam imao hrabrosti da pucam …
Do 1945. niko nije direktno govorio o smrti naučnika. Prve čitulje pojavile su se u inozemstvu tek nakon Drugog svjetskog rata. Jedna od karakterističnih reakcija na takva zlodjela sovjetskog režima bio je izlazak dvojice nobelovaca, Gregoryja Möllera i Henryja Dalea, sa Akademije nauka SSSR -a (1948.). Međutim, u to vrijeme najzanimljivija stvar u životu "proleterske znanosti" tek je počinjala: zvijezda "pravog genija" - Trofim Denisovich Lysenko - ustala je na nebeskom svodu.